Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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