Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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Zfp988F6VKC7 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Zfp988F6VKC7 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Zfp988F6VKC7 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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Zfp988F6VKC7 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Zfp988F6VKC7 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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