Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms