Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms