Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms