Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Atp8b5A3FIN4 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Atp8b5A3FIN4 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms