Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms