Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms