Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms