Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB8

Vmn1r54, Vomeronasal type-1 receptor 54, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r54Q9EPB8 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
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Vmn1r54Q9EPB8 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vmn1r54Q9EPB8 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
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Vmn1r54Q9EPB8 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
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Vmn1r54Q9EPB8 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
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Vmn1r54Q9EPB8 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vmn1r54Q9EPB8 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vmn1r54Q9EPB8 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vmn1r54Q9EPB8 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vmn1r54Q9EPB8 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
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Vmn1r54Q9EPB8 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Vmn1r54Q9EPB8 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
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Vmn1r54Q9EPB8 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Vmn1r54Q9EPB8 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Vmn1r54Q9EPB8 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
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