Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms