Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn23Q9D7D7 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms