Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

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Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Snx29Q9D3S3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Snx29Q9D3S3 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Snx29Q9D3S3 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Snx29Q9D3S3 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Snx29Q9D3S3 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Snx29Q9D3S3 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Snx29Q9D3S3 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
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