Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Snapc3Q9D2C9 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Snapc3Q9D2C9 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Snapc3Q9D2C9 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Snapc3Q9D2C9 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Snapc3Q9D2C9 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Snapc3Q9D2C9 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snapc3Q9D2C9 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Snapc3Q9D2C9 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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