Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms