Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms