Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms