Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.7 ms