Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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