Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms