Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl39lQ9CQD0 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
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Rpl39lQ9CQD0 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
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Rpl39lQ9CQD0 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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Rpl39lQ9CQD0 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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Rpl39lQ9CQD0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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Rpl39lQ9CQD0 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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Rpl39lQ9CQD0 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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Rpl39lQ9CQD0 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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Rpl39lQ9CQD0 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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Rpl39lQ9CQD0 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
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