Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Def8Q99J78 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms