Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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