Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms