Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Smg8Q8VE18 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Smg8Q8VE18 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Smg8Q8VE18 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Smg8Q8VE18 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Smg8Q8VE18 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Smg8Q8VE18 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Smg8Q8VE18 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Smg8Q8VE18 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Smg8Q8VE18 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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