Protein–RNA interactions for Protein: Q8K406

Lgi3, Leucine-rich repeat LGI family member 3, mousemouse

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgi3Q8K406 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Lgi3Q8K406 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lgi3Q8K406 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lgi3Q8K406 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lgi3Q8K406 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lgi3Q8K406 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lgi3Q8K406 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lgi3Q8K406 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lgi3Q8K406 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lgi3Q8K406 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lgi3Q8K406 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lgi3Q8K406 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lgi3Q8K406 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lgi3Q8K406 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lgi3Q8K406 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lgi3Q8K406 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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Lgi3Q8K406 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lgi3Q8K406 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lgi3Q8K406 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lgi3Q8K406 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lgi3Q8K406 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Lgi3Q8K406 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Lgi3Q8K406 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Lgi3Q8K406 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Lgi3Q8K406 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Lgi3Q8K406 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Lgi3Q8K406 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Lgi3Q8K406 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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Lgi3Q8K406 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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