Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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