Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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