Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ssh3Q8K330 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ssh3Q8K330 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ssh3Q8K330 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ssh3Q8K330 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ssh3Q8K330 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ssh3Q8K330 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ssh3Q8K330 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ssh3Q8K330 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ssh3Q8K330 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ssh3Q8K330 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ssh3Q8K330 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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