Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Abcf3Q8K268 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Abcf3Q8K268 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Abcf3Q8K268 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Abcf3Q8K268 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Abcf3Q8K268 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
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