Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbm28Q8CGC6 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbm28Q8CGC6 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbm28Q8CGC6 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbm28Q8CGC6 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbm28Q8CGC6 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbm28Q8CGC6 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm28Q8CGC6 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm28Q8CGC6 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm28Q8CGC6 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm28Q8CGC6 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm28Q8CGC6 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm28Q8CGC6 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm28Q8CGC6 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm28Q8CGC6 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm28Q8CGC6 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm28Q8CGC6 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm28Q8CGC6 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm28Q8CGC6 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm28Q8CGC6 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm28Q8CGC6 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm28Q8CGC6 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm28Q8CGC6 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm28Q8CGC6 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm28Q8CGC6 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm28Q8CGC6 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm28Q8CGC6 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm28Q8CGC6 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm28Q8CGC6 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm28Q8CGC6 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm28Q8CGC6 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm28Q8CGC6 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm28Q8CGC6 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm28Q8CGC6 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm28Q8CGC6 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm28Q8CGC6 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm28Q8CGC6 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm28Q8CGC6 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm28Q8CGC6 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm28Q8CGC6 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm28Q8CGC6 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm28Q8CGC6 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rbm28Q8CGC6 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rbm28Q8CGC6 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rbm28Q8CGC6 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rbm28Q8CGC6 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Rbm28Q8CGC6 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm28Q8CGC6 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm28Q8CGC6 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm28Q8CGC6 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm28Q8CGC6 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm28Q8CGC6 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm28Q8CGC6 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm28Q8CGC6 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm28Q8CGC6 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm28Q8CGC6 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm28Q8CGC6 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm28Q8CGC6 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm28Q8CGC6 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm28Q8CGC6 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm28Q8CGC6 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm28Q8CGC6 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Rbm28Q8CGC6 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Rbm28Q8CGC6 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Rbm28Q8CGC6 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm28Q8CGC6 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Rbm28Q8CGC6 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm28Q8CGC6 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm28Q8CGC6 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Rbm28Q8CGC6 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm28Q8CGC6 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm28Q8CGC6 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm28Q8CGC6 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm28Q8CGC6 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm28Q8CGC6 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm28Q8CGC6 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm28Q8CGC6 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm28Q8CGC6 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm28Q8CGC6 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm28Q8CGC6 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm28Q8CGC6 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm28Q8CGC6 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm28Q8CGC6 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm28Q8CGC6 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm28Q8CGC6 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm28Q8CGC6 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm28Q8CGC6 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm28Q8CGC6 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm28Q8CGC6 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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