Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms