Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4D8

Gm11541, Predicted gene 11541, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11541Q8C4D8 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Gm11541Q8C4D8 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Gm11541Q8C4D8 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Gm11541Q8C4D8 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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