Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Ctdsp2Q8BX07 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Ctdsp2Q8BX07 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Ctdsp2Q8BX07 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Ctdsp2Q8BX07 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Ctdsp2Q8BX07 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Ctdsp2Q8BX07 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
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