Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

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Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Zfp398Q8BV16 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Zfp398Q8BV16 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Zfp398Q8BV16 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Zfp398Q8BV16 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Zfp398Q8BV16 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Zfp398Q8BV16 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Zfp398Q8BV16 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Zfp398Q8BV16 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Zfp398Q8BV16 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Zfp398Q8BV16 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Zfp398Q8BV16 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Zfp398Q8BV16 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Zfp398Q8BV16 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Zfp398Q8BV16 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Zfp398Q8BV16 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Zfp398Q8BV16 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Zfp398Q8BV16 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Zfp398Q8BV16 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Zfp398Q8BV16 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Zfp398Q8BV16 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Zfp398Q8BV16 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Zfp398Q8BV16 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms