Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms