Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

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Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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RgmaQ6PCX7 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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RgmaQ6PCX7 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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RgmaQ6PCX7 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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RgmaQ6PCX7 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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RgmaQ6PCX7 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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RgmaQ6PCX7 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RgmaQ6PCX7 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms