Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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