Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Krt39Q6IFX4 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Krt39Q6IFX4 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Krt39Q6IFX4 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt39Q6IFX4 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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