Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Krt40Q6IFX3 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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