Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Q6DFW0 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q6DFW0 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q6DFW0 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms