Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Pkp4Q68FH0 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Pkp4Q68FH0 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Pkp4Q68FH0 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Pkp4Q68FH0 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Pkp4Q68FH0 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Pkp4Q68FH0 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Pkp4Q68FH0 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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