Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Taf6Q62311 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Taf6Q62311 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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