Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm29548-201ENSMUST00000187012 694 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm28105-201ENSMUST00000187788 694 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm7815-201ENSMUST00000196104 832 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Fxyd7-202ENSMUST00000206341 620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 AL844586.1-201ENSMUST00000224297 1042 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Fxyd7-201ENSMUST00000073892 693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm27149-201ENSMUST00000184716 1266 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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