Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Hes3Q61657 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Hes3Q61657 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Hes3Q61657 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
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Hes3Q61657 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Hes3Q61657 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Hes3Q61657 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Hes3Q61657 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hes3Q61657 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms