Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms