Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot7Q60809 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms