Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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