Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psme4Q5SSW2 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms