Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp48Q3V0C5 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp48Q3V0C5 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp48Q3V0C5 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp48Q3V0C5 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp48Q3V0C5 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp48Q3V0C5 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp48Q3V0C5 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Usp48Q3V0C5 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Usp48Q3V0C5 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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